iGEM Leiden
iGEM (international Genetically Engineering Machine) is een wereldwijde wedstrijd die zich focust op het verbeteren van de wereld met synthetische biologie. 375 teams werken in het laboratorium tot het moment van de waarheid: de jamboree in oktober 2019 in Boston (USA).
Volg Team Leiden
Wij als iGEM Leiden gaan deze zomer met een team van elf studenten aan de slag om het eiwit suckerine te produceren met behulp van de bacterie E.coli en andere organismen. Suckerine is een eiwit dat voorkomt in de zuignaptanden van de Humboldt-pijlinktvis. De inktvis gebruikt deze tanden om zijn prooi aan de haak te slaan. Dit eiwit moet dan ook sterk en flexibel zijn anders is het dikke pech, prooi weg! Deze bijzondere eigenschappen maken dit eiwit erg geschikt als vervanger voor menselijke huid. Wij gaan deze kennis gebruiken om een gel te maken die mensen met brandwonden en/of chronische wonden kan genezen.
Het is 4 november, de laatste dag van de iGEM-conferentie in Boston. Tijdens een ceremonie, de Giant Jamboree, worden de winnaars van de competitie bekendgemaakt. Vol spanning kijken we op het scherm naar de genomineerden voor de verschillende tracks. Verbaasd zien we dat we genomineerd zijn voor best manufacturing. Een ogenblik later hebben we gewonnen.
Tijdens de Giant Jamboree in Boston kwamen 360 teams van over de hele wereld samen om hun onderzoek te presenteren. De onderwerpen waren divers, van ziektedetectie in wijnranken tot spinnenzijdeproductie in bacteriën. Zelf hebben wij gewerkt aan een nieuwe hydrogel om brandwondpatiënten te genezen. In de track manufacturing was het belangrijk om een nieuw product te maken of de productie van een al bestaand product te verbeteren. Tijdens onze presentatie had zowel de jury als het publiek (een volle zaal) veel interesse in ons onderzoek.
De jury was onder de indruk van ons suckerine-eiwit (zie kader). Ook onze website viel in de smaak: die werd beoordeeld als mooi en overzichtelijk. Daarnaast kregen we complimenten voor ons wiskundige model dat we hebben gebruikt om de productie van ons eiwit te verhogen. Een jurylid zei: “Hoewel veel teams van plan zijn om dit soort modellen te gebruiken, maken slechts weinigen veel vooruitgang.”
De code staat online
Maar winnen is niet het belangrijkste. “iGEM is een grote gemeenschap”, werd vaak gezegd door deelnemers en juryleden tijdens de conferentie. Niet alleen staken we veel op van presentaties en posters van andere teams, we hebben ook veel nieuwe vrienden gemaakt.
De reis van ons team is in ieder geval nog niet ten einde. De komende jaren zullen we verschillende toepassingen van het suckerine-eiwit verder onderzoeken. Door de bijzondere eigenschappen van het eiwit, zoals de sterkte en flexibiliteit, kan het bijvoorbeeld worden gebruikt voor medische apparaten. We hopen dat toekomstige iGEM-teams aan de slag gaan met ons eiwit. De genetische code ervan hebben we namelijk al online gezet. Daarnaast zal een nieuw Leids iGEM-team in januari aan de slag gaan met een nieuw, zelf gekozen onderwerp. We kijken uit naar alle mooie ontdekkingen die zullen worden gedaan.
Deze blog is geschreven door teamlid van iGEM Leiden Maarten Lubbers
Eerdere blogs van iGEM Leiden 2019:
- Blog 1. Geloof, dromen en sucherine?!
- Blog 2. Van inktviseiwit naar brandwondgenezing: een reis van ideeën
- Blog 3. We zijn niet de enigen die moeite hebben bacteriën te laten groeien
- Blog 4. Erlenmeyers zijn kinderspel, tijd voor de bioreactor
- Blog 5. Wel of geen gemodificeerde baby’s? Stand blijft 1-1
Lees hier hoe het eraan toe ging bij het iGEM-team in Delft,